원자, 분자가 눈에 보이는 물질인가요?

물의 화학식을 예를 들면,
수소와 산소원자가 결합하고 잇다는게 눈에 보입니까?
눈에 보이지도 않는 물질들을 어떻게 알게 되엇나요?