저도 예전에 차 탈 때 에어컨 냄새 때문에 고생한 적이 있어서 그 찝찝한 마음 너무 잘 알아요.ㅠㅠ
필터를 교체했는데도 냄새가 나는 건에어컨 안쪽에 습기가 차서 곰팡이가 생겼기 때문일 가능성이 커요. 먼저 목적지에 도착하기 5분 전쯤에 에어컨 버튼만 끄고 송풍 상태로 바람 세기를 강하게 해서 안쪽의 물기를 바짝 말려주는 습관을 가져보세요. 이미 냄새가 심하다면 차를 세워두고 창문을 다 연 다음 히터를 가장 높은 온도와 강한 바람으로 10분 정도 틀어주면 안쪽이 소독되면서 냄새 잡는데 도움이 됩니다.
만약 이렇게 해도 해결이 안 된다면 에어컨 안쪽 냉각기를 직접 청소하는 에바크리닝을 한 번 받아보시는 게 가장 좋을 것 같네요.