ISA 계좌는 자산 운용 방식에 따라 투자자가 직접 운용하는 중개형 ISA, 금융기관이 지시에 따라 운용하는 신탁형 ISA, 금융기관 전문가에게 운용을 일임하는 일임형 ISA로 나뉘며, 가입자의 소득 및 연령에 따라 비과세 혜택의 차이가 있는 일반형 ISA(19세 이상 거주자, 순이익 200만원까지 비과세), 총 급여 5천만원 또는 종합소득 3,800만원 이하 근로자·사업자에게 순이익 400만원까지 비과세 혜택을 주는 서민형 ISA, 이와 동일한 혜택을 농어민에게 제공하는 농어민형 ISA 등이 있습니다.