맥문동은 뿌리가 깊고 사방으로 번지는 덩이뿌리 특성이 있어 손으로 그냥 뽑기가 매우 까다로운데, 직접 뽑지 않고 제거하려면 잔디에는 피해를 주지 않으면서 맥문동 같은 화본과나 광엽잡초를 선택적으로 제거하는 '잔디 전용 제초제(파란들 등)'를 희석해 맥문동 잎과 뿌리 주변에 살포하는 방법이 있으며, 약제를 쓰고 싶지 않다면 맥문동이 자란 부위에 두꺼운 검은색 천막 천이나 비닐을 씌워 햇빛을 완전히 차단하는 '차광법'을 수주일간 유지해 식물을 자연 고사시키는 방법이 가장 효과적입니다.