Western blot 과 sds-page 가 서로 다른 실험인가요?
안녕하세요. 박창민 수의사입니다. Western blot과 SDS-page는 다른 실험이며 보통 SDS page를 먼저 하고 Western blot을 하게 됩니다. SDS-page는 단백질을 분리하는 전기영동 실험방법이며 Western blot은 혼합물 내 특정 단백질의 존재를 확인하는 분석 기술입니다. 감사합니다.
Western blot은 항체를 이용하여 단백질을 검출하는 일련의 실험인데요, 이 western blot의 초기 단계로 sds-page를 진행하게 됩니다. 먼저 단백질들을 아크릴아마이드 전기영동(sds-page)을 통해 분리하고 -> 분리된 단백질들을 여과막(filter membrane)으로 옮기는 블로팅(blotting)을 거친 후 -> 최종적으로 탐침(probe)을 검출하는 단계로 진행하는 것이죠.
SDS-page는 SDS가 포함된 겔을 이용해 단백질에 음전하를 띠게하고 전기영동하여 분리하는 실험입니다.
Western blot은 SDS-page로 분리한 단백질에 1차항체와 2차항체를 결합시켜 검출하고자 하는 표적 단백질을 굉장히 민감하게 검출 할 수 있습니다.
항체사용을 통한 표적단백질의 민감한 검출이 Western blot의 주요 특징이라고 할 수 있습니다.
SDS-page는 시행한 후 western blot 할 수도 있지만 1차로 시행한 겔 안의 시료들을 수직방향으로 한 번 더 SDS-page하여 2D전기영동을 할 수 있습니다. 이 경우 기존 시료 안의 모든 단백질을 분리할 수 있습니다. 한 시료 안의 여러가지 단백질을 비교분석 할 수 있습니다.
SDS-PAGE의 경우 단백질의 크기에 따라 분리하는 요법이며, Western blotting의 경우, SDS PAGE에서 분리한 단백질들에 특이 항체들을 붙여 단백질을 검출하는 방식입니다.
굳이 순서를 말한다면 SDS PAGE를 시행 후, Western blotting을 시행하였다가 보다 과학적인 근거가 있는 답변이겠지요.
두 방법 모두 단백질 연구에 매우 중요하며 자주 함께 사용되지만, 각 실험의 기능과 목적이 다릅니다.
SDS-PAGE(Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis)
단백질의 크기에 따라 분리하는 기법입니다. 이 실험은 라우릴황산나트륨(SDS)라는 음이온성 계면활성제를 사용하여 단백질의 2차,3차 구조를 파괴하고 단백질에 음전하를 부여합니다.
Western Bolt
특정 단백질을 검출하고 확인하는 데 사용됩니다. SDS-PAGE로 단백질을 분리한 후, 이 단백질들을 폴리아크릴아마이드 겔에서 멤브레인(PVDF)으로 transfer 합니다. 이 멤브레인에 특정 단백질을 인식할 수 있는 항체를 처리하여 검출합니다.SDS-PAGE와 웨스턴 블랏은 다른 실험 방법입니다.
SDS-PAGE: 단백질을 크기에 따라 분리하는 전기영동 방법
웨스턴 블랏: SDS-PAGE로 분리된 단백질을 막으로 전이시킨 후, 특정 단백질을 항체로 검출하는 방법
즉, SDS-PAGE는 단백질 분리 방법이고, 웨스턴 블랏은 분리된 단백질 중 특정 단백질을 확인하는 방법입니다.