대학교 입학이 결정나고 1학기 등록금 납부를 하지 않으면 합격취소처리됩니다.
2학기부터는 등록금납부를 하지 않아도 가능하지만, 군대에 있을동안 학비가 상승했다면 상승한 등록금을 납부하셔야 하기때문에 물가상승률을 반영하여 군 제대 후에 등록금이 상승할것같으면 등록금납부 후에 휴학하고 군입대하는것이 좋습니다.
그리고 질문하신 내용, 1학년 1학기 등록금을 완납하지 않으면 휴학처리가 아니라 입학이 취소처리되기때문에 완납하시고, 군입대영장이 나온것을 갖고 휴학처리를 진행하시면 됩니다.
보통은 대학가기 전에 군대가지않는데, 일부 고등학교 졸업하기 전에 군입대신청하는 경우가 있더군요.그럴땐 병무청이나 학교측에 문의해보시는게 좋습니다.