종합소득세 삼쩜삼이랑 홈텍스 왜 다른거에요??

제가 삼쩜삼에서는 수수료를 내고 환급금을 받을 수 있어서 수수료 낸 후 신청은 해놓은 상태인데 이게 삼쩜삼이 믿을게 못된다 라는 분들도 계셔서 홈텍스에서 조회하고 다음날 조회결과가 나왔는데 홈텍스는 환급이 아닌 납부를 해야하고 수수료도 더 많이 나오더라구요 이런 경우가 있나요 ??