운동 선수가 프로 입단 전에 대학을 거치는 것과 안가는 것과는 차이가 큰가요?

주위에 고교 야구 선수가 있는데, 야구로 대학에 갈지 프로에 갈지 고민이라고 합니다. 아직은 고2라서 시간적인 여유가 있는데, 프로 야구 구단이라도 대졸과 고졸의 차이는 큰가요?