정부 부처 간의 협력은 어떻게 이루어지나요?

보통 공공기관은 최고 높은기관이 정부라고 생각이 드는데요 정부와 각 지자체간의 협력은 어떤식으로 이루어지는지 궁금해서 물어보려고 합니다 알려주세요