애플리케이션 용 서버 OS는 어떤게 좋은가요? 윈도우vs리눅스 ?

서버를 구축하려 하는데 OS를 선택하는데 있어 윈도우와 리눅스 중 어느 것이 좋은지 잘 모르겠습니다.

사실 아직 리눅스는 한 번도 사용해 본 적이 없는데 리눅스 서버를 많이 사용하는데에 이유가 있다고 생각되어 이번 기회에 구축해보려 하는데 많이 어려운가요?

애플리케이션과 연동해서 사용하려 하는데 리눅스와 윈도우 서버의 차이가 크게 없으면 그냥 윈도우를 쓰는게 좋을까요?