질문자님께서 말씀하신 것처럼 독감 예방주사에는 원치않는 알레르기와 같은 합병증이 발생할 가능성이 있으나, 독감에 걸려서 나타날 수 있는 폐렴과 같은 합병증이 오히려 질문자님의 중증 질환의 위험도를 높일 확률이 더 가능성이 있기 때문에 비록 외출을 자주 하지 않으신다 하시더라도 이전에 예방접종 후 특별한 부작용이 없으셨다면 예방접종을 하시는 것이 더 좋을 것으로 사료됩니다.
다만 기저 질환에 따라 예방접종을 조심해야 하는 경우가 있기 때문에 접종 전 사전 진료를 통해 확인해 보시는 것도 도움이 되겠습니다.