Palindrome하지않은 서열을 인식하는 제한효소도 존재하나요?

Question

생명과학 전공 서적을 찾아보면 대부분의 제한효소는 palindrome한 서열을 인식한다고 나와있던데, 막상 palindrome하지않은 서열을 인식하는 제한효소는 검색해도 나오지 않더라고요. 그냥 제한효소는 palindrome한 서열을 인식한다고 보면 되나요?

Answer 1

일반적으로 대부분의 제한효소는 palindrome한 서열을 인식하도록 설계되어 있습니다. 그러나 이는 모든 제한효소에 해당하는 것은 아닙니다. 일부 제한효소는 palindrome하지 않은 서열도 인식할 수 있으며, 이는 해당 제한효소의 성질과 작용 메커니즘에 따라 달라집니다. 따라서, palindrome한 서열을 인식하는 제한효소가 대부분이지만, 모든 제한효소가 그렇지는 않다는 점을 염두에 두시면 좋을 것 같습니다.

Answer 2

안녕하세요. 김경태 과학전문가입니다.

네, Palindrome이 아닌 서열도 인식하는 제한효소가 존재합니다. Palindrome이 아닌 서열을 인식하는 제한효소는 비 Palindrome제한효소(non-palindromic restriction enzyme)라고도 하며, DNA 서열 내에 특정 패턴을 인식하여 그 패턴에 해당하는 특정 지점에서 DNA를 절단합니다. Palindrome 제한효소와 달리 인식 패턴이 서로 대칭이 아니기 때문에 DNA가 절단된 후 생성되는 sticky end도 대칭이 아닐 수 있습니다. 대표적인 비 Palindrome 제한효소로는 EcoRV, HhaI, HpaII 등이 있습니다.