크리스퍼 유전자 가위는 20~40개의 염기서열을 자를 수 있지만, 1000개 이상의 염기서열을 가진 유전자를 무력화시키기에는 한계가 있습니다. 크리스퍼는 정확성이 높은 도구이지만, 유전자의 구조나 역할에 따라서는 자르기가 어렵거나, 오히려 원치 않는 부작용을 초래할 수 있습니다. 또한, 크리스퍼 유전자 가위는 유전자 뿐 아니라, 세포 내부에 있는 다른 분자들도 자를 수 있기 때문에, 연구자들은 크리스퍼 유전자 가위의 사용에 있어서 매우 신중해야 합니다. 따라서, 크리스퍼 유전자 가위로 모든 유전자를 무력화시키는 것은 불가능하며, 사용에 있어서는 신중하게 접근해야 합니다.