교회는 대체로 미사나 예배 때 신자들이 내는 헌금(기부금)으로 운영됩니다. 그리고 교회의 신자들은 한 달에 한 번 교회에 한 달 월급(수익금)의 십분의 일 정도를 냅니다. 가톨릭 교회의 경우 이를 교무금, 개신교 교회는 십일조라고 부릅니다.
이처럼 헌금과, 교무금이나 십일조로 교회가 운영되며, 교회는 헌금으로 편성된 운영 기금 중에 이웃을 돕고, 사회 복지 사업 선교 등으로 일정 부분 사용하기도 합니다.
교회는 이밖에도 컨소시엄을 구성하여 교육사업으로 학교를 설립하여 운영하거나, 병원 사회 복지기관 등을 운영하기도 합니다.
심지어 교회가 신문 방송사 등의 언론사를 소유한 경우도 있습니다.