갑근세,주민세를 매달월급에서 공제하는것과 연말정산시 차감하는것 뭐가다르고 장단점이뭔가요?

작년까지 급여에서 공제하고 월급이나왔는데 올해부터 갑근세,주민세 차감하지않고 연말정산시에 차감한다고 회사 경리가 안내를 해주었는데

제 입장에서 잘모르지만 매달내는게 연말정산시 차감하는것보다 덜부담인거 같은데

두가지경우 뭐가 다르고 장단점이 뭔지 알려주세요ㅜㅜ