안녕하세요. 양승훈 회계사입니다.
결론부터 말씀드리면, 10만 원 전액 세액공제를 받으시는 것이 맞습니다.
원천징수영수증의 세액공제 상세 내역은 기본적으로 '국세(소득세)'만을 기준으로 보여주기 때문에 90,909원만 기재되어 있는 것인데요. 영수증 첫 장의 세액 계산 부분을 보시면 세금이 소득세 / 지방소득세로 나누어져 있는 것을 확인하실 수 있습니다.
국세(소득세)에서 공제가 이루어지면, 지방소득세에서도 자동으로 그 금액의 10%가 추가로 공제됩니다.
따라서 눈에 바로 보이지 않았던 나머지 10% 금액(9,091원) 마저 전액 공제가 되므로 안심하셔도 됩니다.
답변이 도움이 되셨길 바랍니다.