몇년전 퇴직자에게 미지급한 연차수당 지급시 세금을 떼야하나요?

안녕하세요. 감단직근로자 법률 개정으로 저희가 이번에 미지급한연차수당을 퇴직자에게 지급하게 되었습니다. 이런 경우에도 세금을 공제해야하는지 궁금하여 문의드리게되었습니다. 다른 부서 사람들은 이런경우 비과세 또는 연말정산 때 처리할 수 있다라고 하는데 정확히 알고싶어서 문의드리게되었습니다. 감사합니다.