유산균은 위산이나 담즙산에 약하기 때문에 공복에 복용하시는 것이 가장 효과가 좋습니다. 이런 이유 때문에 공복으로 유지된 시간이 긴 아침 공복에 복용하는 것을 가장 권장하기는 하나, 저녁 식사와 취침 전 유산균 복용까지 충분한 시간 간격이 띄워져 있다면 취침 전에 유산균을 복용하셔도 괜찮습니다.
아침 공복에 유산균을 복용한 이후에 식사와의 간격이 길지 않은 경우에는 유산균이 오히려 위산의 영향을 받을 수 있기 때문에 취침전에 복용하는 것을 권장하기도 합니다.