파충류의 종에 따라 다르긴 하지만, 파충류의 몸에는 다양한 종류의 줄기세포가 존재합니다. 이 줄기세포들은 손상된 부위로 이동하여 새로운 세포로 분화하게 됩니다. 특히, 꼬리 재생의 경우, 꼬리 절단 부위에서 '재생아'라는 조직이 형성되고, 이 재생아에서 새로운 뼈, 근육, 신경 등이 만들어집니다.
또한 재생 과정은 특정 유전자들의 발현을 통해 조절됩니다. 이 유전자들은 세포의 성장, 분화, 조직 형성을 담당하며, 이러한 유전자들의 활발한 작용으로 인해 잘린 부위가 복원될 수 있는 것입니다.
또한 환경적 요인에고 크게 영향을 받습니다. 특히 온도와 영양 상태 등 환경적 요인도 재생 속도와 정도에 영향을 미치게 되는데, 대부분의 파충류는 변온동물이기 때문에 온도가 높을수록 신진대사가 활발해져 재생 속도가 빨라지는 경향을 보입니다.