대체당(대체감미료)는 일반적으로 안전한 것으로 보이나, 일부 부작용이 발생할 수 있습니다. 가장 큰 부작용으로는 소화불량 및 복부 팽만감과 설사 등을 유발합니다. 그 다음으로 보고된 부작용으로는 혈당 수치에 영향을 미치기도 한다는 것입니다. 하지만 이는 일일 권장량을 넘어서 과다 복용 했을 경우 발생하는 경우이므로 적정량을 섭취하는 것이 중요합니다. 그 밖에도 아주 희박한 경우이지만 대체당을 섭취 후 두통과 어지러움을 호소한 사람들도 있었으며, 우울증이나 기분 변화를 겪었다는 보고도 있습니다.