E비자 프리랜서 사업소득세 신고가능한가요?

공단에서 직접받은인원은 아니고 다이렉트로 저희쪽에서 고용했는데 E비자는 프리랜서로 신고해도 세금적이나 출입국적으로 문제생기지않나요?