자진납세와 고지에 의한 납세가 금액이 다르다면

납세자가 자진 납세했을때 세무서에서는 그대로 인정해 주는지 아니면 납세한 부분에 대해서 적정여부를 확인하는 절차가 있는지 궁금하네요,