포괄임금제 적용 연차수당, 퇴직금 계산 항목

이번년도부터 포괄임금제 도입하여 근로계약을 체결한다고 합니다..

예를 들어, 연봉 3,600만원일 경우

기존에는 기본급 2,800,000원 + 연구활동비 200,000원 이였는데

포괄임금제 도입 후

기본급 2,390,909원 + 연장수당 409,091원+ 연구활동비 200,000원 이렇게 급여항목이 이뤄지는데

궁금한점은

1. 기존보다 기본급이 낮아지는건데 불이익이 있나요? 어떤점이 있나요?

2. 연차수당 계산시 통상임금 포함인 항목이 어떤건가요?

기본급,연장수당,연구활동비 다 포함한 300만원으로 계산을 해야하나요?

3. 퇴직금 계산시에 포함하여야 할 항목 또한 알려주세요..