속쓰림, 구토, 설사, 복통, 어지러움, 두통, 혈액 응고 장애, 과민성 반응 등이 있으며, 양파는 칼륨이 풍부한 음식이기 때문에, 신장 질환이 있는 사람은 섭취를 제한해야 합니다. 또한, 양파는 혈액 응고를 방해하는 성분이 있기 때문에, 수술을 앞두고 있는 사람은 섭취를 피해야 합니다.
양파는 위장이 약한 사람이라면 복용 시 주의하는 것이 좋습니다. 위장이 약한 사람이 공복에 섭취할 경우 속 쓰림을 느낄 수 있으므로, 되도록 식후에 섭 취하는 것이 좋습니다. 양파즙은 간이나 담이 안좋은 사람이 장기 간 복용하는 것은 좋지 않다고 하며, 복용 후 혀에 백태가 끼거나 기미가 생길 경우에는 즉시 복용을 중단해야 한다고 합니다.